分子探针与表观遗传学研究好文分享:LINC00924诱导的脂肪酸代谢重编程通过hnRNPC调控的Mnk2选择性剪接促进胃癌腹膜转移(IF=9.685)
发布时间 :2022-11-29
刊登于《Cell Death and Disease》(IF=9.685)

LINC00924-induced fatty acid metabolic reprogramming facilitates gastric cancer peritoneal metastasis via hnRNPC regulated alternative splicing of Mnk2Cell Death and Disease(IF=9.685)

 

 

胃癌(GC)腹膜转移(PM)是胃癌患者死亡的常见原因。


FA代谢重编程,通常发生在FA氧化(FAO)和脂质合成的增加,可能为癌细胞在转移过程中提供选择性优势。


LncRNA可能通过改变RNA稳定性来调节FAO相关基因的表达,并可能通过ceRNA(竞争内源性 RNA )机制激活与脂质代谢相关的重要信号通路。


很少有研究研究lincRNAs在调节AS在脂质代谢重编程中的作用,特别是在GC PM中。

 


在本研究中,研究团队检测了lncRNAGC原发灶和腹膜灶中的表达谱,并鉴定出LINC00924GC PM相关的lncRNA


研究团队发现LINC00924在胃癌患者中高表达,其高表达介导了广泛的PM


研究团队发现,LINC00924调控GC细胞脂质代谢重编程,从而促进了基质分离的GC细胞存活和球体形成。


关于其机制,LINC00924通过与hnRNPC结合调控MNK2 pre-mRNA AS


具体而言,LINC00924促进hnRNPCe14a处的MNK2 pre-mRNa结合,从而下调Mnk2a的剪接,调控p38 MAPK/PPARα信号通路。


此外,一项体内研究显示,下调LINC00924可强烈抑制GC的生长,并减弱体内腹膜播散,研究团队的研究结果扩展了对lncRNA介导的癌症转移的理解,这可能对预防和治疗胃癌PM潜在有效。

 

 

LINC00924在进行腹膜转移的体内环境模拟后表达显著增加,其表达与低总生存率密切相关。


另外细胞功能实验结果表明LINC00924作为一种促进胃癌侵袭和转移的致癌基因。


LINC00924通过p38MAPK/PPARα通路促进脂质代谢重编程。

 


为了阐明LINC00924基因在GC PM中的作用机制,研究团队利用RNA pulldownMSRAP、和RIP等方法研究其调控通路和靶点。

 

 

通过RNA pulldown和质谱分析来识别潜在的相互作用蛋白。


hnRNPCLINC00924相互作用,RNA pulldown结果显示,LINC00924片段672-1342hnRNPC共沉淀。


这些实验结果表明,hnRNPC是一个LINC00924相关蛋白。

 

 

通过RAP实验验证了Mnk2 pre-mRNALINC00924e14a之间的物理相互作用,结果显示e14aLINC00924组中富集。


LINC00924可以调控Mnk2 pre-mRNA AShnRNPC基因敲低并没有破坏LINC00924Mnk2 pre-mRNAe14a形成的RNA-RNA双工结构。

 


Mnk2a剪接的下调促进了FAOFA的摄取,从而促进了GC PM


这一发现扩展了研究团队Mnk2在肿瘤发生发展过程中的功能的理解,并确定了Mnk2GC PM治疗的潜在治疗靶点。


研究团队发现LINC00924在体内外对GC细胞生长和PM形成是必需的。


研究团队的研究结果扩展了对lncrna介导的癌症转移的理解,并可能对预防和治疗胃癌PM可能有效。

 



 

 

作者使用伯信生物明星产品RNA PulldownRAP试剂盒进行了上述分子互作调控机制的研究。

 

 

 

 


原文链接:https://www.nature.com/articles/s41419-022-05436-x