LINC00924-induced fatty acid metabolic reprogramming facilitates gastric cancer peritoneal metastasis via hnRNPC regulated alternative splicing of Mnk2《Cell Death and Disease》(IF=9.685)
胃癌(GC)腹膜转移(PM)是胃癌患者死亡的常见原因。
FA代谢重编程,通常发生在FA氧化(FAO)和脂质合成的增加,可能为癌细胞在转移过程中提供选择性优势。
LncRNA可能通过改变RNA稳定性来调节FAO相关基因的表达,并可能通过ceRNA(竞争内源性 RNA )机制激活与脂质代谢相关的重要信号通路。
很少有研究研究lincRNAs在调节AS在脂质代谢重编程中的作用,特别是在GC PM中。
在本研究中,研究团队检测了lncRNA在GC原发灶和腹膜灶中的表达谱,并鉴定出LINC00924为GC PM相关的lncRNA。
研究团队发现LINC00924在胃癌患者中高表达,其高表达介导了广泛的PM。
研究团队发现,LINC00924调控GC细胞脂质代谢重编程,从而促进了基质分离的GC细胞存活和球体形成。
关于其机制,LINC00924通过与hnRNPC结合调控MNK2 pre-mRNA AS。
具体而言,LINC00924促进hnRNPC与e14a处的MNK2 pre-mRNa结合,从而下调Mnk2a的剪接,调控p38 MAPK/PPARα信号通路。
此外,一项体内研究显示,下调LINC00924可强烈抑制GC的生长,并减弱体内腹膜播散,研究团队的研究结果扩展了对lncRNA介导的癌症转移的理解,这可能对预防和治疗胃癌PM潜在有效。
LINC00924在进行腹膜转移的体内环境模拟后表达显著增加,其表达与低总生存率密切相关。
另外细胞功能实验结果表明LINC00924作为一种促进胃癌侵袭和转移的致癌基因。
LINC00924通过p38MAPK/PPARα通路促进脂质代谢重编程。
为了阐明LINC00924基因在GC PM中的作用机制,研究团队利用RNA pulldown、MS、RAP、和RIP等方法研究其调控通路和靶点。
通过RNA pulldown和质谱分析来识别潜在的相互作用蛋白。
hnRNPC与LINC00924相互作用,RNA pulldown结果显示,LINC00924片段672-1342与hnRNPC共沉淀。
这些实验结果表明,hnRNPC是一个LINC00924相关蛋白。
通过RAP实验验证了Mnk2 pre-mRNA的LINC00924与e14a之间的物理相互作用,结果显示e14a在LINC00924组中富集。
LINC00924可以调控Mnk2 pre-mRNA AS;hnRNPC基因敲低并没有破坏LINC00924和Mnk2 pre-mRNA的e14a形成的RNA-RNA双工结构。
Mnk2a剪接的下调促进了FAO和FA的摄取,从而促进了GC PM。
这一发现扩展了研究团队对Mnk2在肿瘤发生发展过程中的功能的理解,并确定了Mnk2是GC PM治疗的潜在治疗靶点。
研究团队发现LINC00924在体内外对GC细胞生长和PM形成是必需的。
研究团队的研究结果扩展了对lncrna介导的癌症转移的理解,并可能对预防和治疗胃癌PM可能有效。
作者使用伯信生物明星产品RNA Pulldown和RAP试剂盒进行了上述分子互作调控机制的研究。