免疫细胞间相互识别的物质基础是细胞膜分子，包括细胞表面的多种抗原、受体或其他分子，细胞生长发育过程中，处于不同阶段的细胞或不同亚型的细胞，其表面有不同的标记，根据这些不同的标记，使用相应的抗体将细胞进行分类，称之为免疫分型。。

流式细胞术（flow cytomertry, FCM）是利用流式细胞仪进行的一种单细胞定量分析和分选技术。流式细胞术是单克隆抗体及免疫细胞化学技术、激光和电子计算机科学等高度发展及综合利用的高技术产物。流式细胞术应用范围包括：免疫细胞表面标志、细胞分型及分选、细胞内或细胞核内抗原、细胞凋亡、DNA含量与细胞周期、细胞增殖、细胞毒性、可溶性蛋白质分子、报告基因、胞内活性氧水平、细胞膜电位及细胞内钙离子浓度等检测。