TRAP( tagged RNA affinity purification)是一种通过设计ncRNA-MS2载体与GST-MS2融合表达载体并共转细胞,以检测与ncRNA结合的蛋白质(RBPs)或RNA的研究方法。根据研究对象的不同,TRAP可与高通量测序、qPCR联用,鉴定与ncRNA结合的RNA种类与相互作用水平;或是与MS、Western blot联用,鉴定与ncRNA结合的蛋白质种类与结合强度。 (本试剂盒仅供科研用途)
实验原理:
TRAP方法首先设计GST-MS2融合表达载体和ncRNA-MS2茎环结构串联重复载体,共转细胞获得GST-MS2融合蛋白和ncRNA-MS2融合RNA,在胞内形成GST-MS2~ncRNA-MS2与蛋白或RNA的复合体;然后裂解细胞,利用谷胱甘肽亲和琼脂糖磁珠拉取获得目的蛋白-RNA复合物;最后进一步分离纯化,获得目的蛋白或目的RNA进行下一步检测分析。
产品优势:
1. 伯信独立研发。
2. 解决了传统的TRAP实验目前只应用于LncRNA等互作RNA或蛋白研究的局限性问题。
3. 使用环状RNA表达载体而非探针进行杂交,避免了circRNA研究中接头序列被蛋白结合后探针不能结合circRNA导致的假阴性影响,且降低了探针杂交过程中RNA的降解。
技术流程:
结果实例
文章案例
Periodicals:Molecular Cancer
IF:27.700
Periodicals:Journal of nanobiotechnology
IF:10.200
Periodicals:Cell Biology and Toxicology
IF:5.300
Periodicals:Molecular Cancer
IF:37.299
Article:LINC02159 promotes non-small cell lung cancer progression via ALYREF/YAP1 signaling
Periodicals:Molecular Cancer
IF:37.299
Periodicals:Molecular Cancer
IF:37.299
Periodicals:Journal of Experimental & Clinical Cancer Research
IF:11.300
Article:Circular RNA circLAMA3 inhibits the proliferation of bladder cancer by directly binding an mRNA
Periodicals:Molecular Therapy: Oncolytics
IF:5.700
Article:Circular RNA circGLIS3 promotes bladder cancer proliferation via the miR-1273f/SKP1/Cyclin D1 axis
Periodicals:Cell Biology and Toxicology
IF:6.100
Periodicals:Molecular Cancer
IF:37.300