配对末端标签测序ChIA-PET技术应用了PET测序技术的基本原理。PET测序技术的独特之处在于构建配对末端测序模板。从目的DNA片段两个末端提取短标签并将它们配对构成一个PET，对PET进行高通量测序，利用标签序列定位目的DNA片段在基因组中的位置。为了获得短标签，将目的DNA片段两个末端分别与设计好的半连接子(linker)相连。半连接子为具有MmeI限制性内切酶识别位点的寡聚核苷酸序列，而MmeI限制性内切酶能够水解其识别位点下游18/20个碱基对。连接子连接后将DNA片段两个末端配对，随后加入MmeI限制性内切酶，便可得到“标签-连接子-标签(tag-linker-tag)”结构。

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①　物种信息、基因 ID；

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①　实验报告（实验仪器、试剂、方法、结果、结论）。