ChIRP
发布时间 :2017-07-21
检测调节RNA结合调控的DNA和蛋白质

 RNA纯化的染色质分离技术(Chromatin Isolation by RNA Purification,ChIRP)是一种检测与RNA绑定的DNA和蛋白的高通量检测方法。
       其方法是通过设计生物素标记RNA互补探针,其与链霉亲和素结合,将目标RNA特异性结合的同时,特异性捕获RNA结合调控的DNA染色体片段及参与转录调控的RNA结合蛋白质(RBPs)。

①DNA染色体片段经过构建文库及高通量测序,可以基因组水平获得转录调控RNA(增强子RNA,eRNA)转录调控的下游靶基因,结合qPCR可以研究结合调控强度;
②RNA结合蛋白经过酶消化及高效液相-质谱分析,可以鉴定参与转录调控的蛋白质,结合western blot可以进一步研究结合作用强度



客户提供

① 活细胞(>107cell);

② 新鲜组织:大于0.5g

③ RNA信息、物种信息ID;


伯信提供

① 检测报告(实验仪器、试剂、方法、结果、结论);

② 探针组;

③ MS:搜库结果;

④ ChIRP-DNA:下游靶基因名称、PCR电泳图、高通量测序数据


结果实例



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