CLIP(crosslinking-immunoprecipitation)实验是一种用于研究RNA与蛋白质相互作用的强大技术,广泛应用于识别和解析RNA-蛋白质复合物的组成及其作用机制。通过该技术,研究者能够捕捉到在生物学过程中,特别是在RNA修饰、RNA剪接和RNA稳定性等方面RNA结合蛋白(RBP)与RNA之间的相互作用。
实验原理:
CLIP(交联免疫沉淀)实验是一种用于研究RNA与蛋白质相互作用的技术,通过交联RNA和RNA结合蛋白(RBP)之间的物理接触,并利用免疫沉淀来富集和分析这些RNA-蛋白质复合物;PAR-CLIP 是 CLIP(交联免疫沉淀)实验的一种改进方法,结合了光激活的核糖核苷(通常是 4-thiouridine (4SU) 等)技术,能够更加高效、精确地捕获 RNA 与蛋白质之间的相互作用。
CLIP-qPCR(crosslinking-immunoprecipitation and qPCR)是通过免疫共沉淀RBP-RNA复合物,获取纯化及消化(蛋白酶K、DNaseI、RNase T1)后的RNA,并通过对RNA 3’-端加接头和设计不同位点的引物,进行RNA结合蛋白位点的富集效率检测。
CLIP-seq(crosslinking-immunoprecipitation and High throughput sequencing)是通过免疫共沉淀RBP-RNA复合物,获取纯化及消化(蛋白酶K、DNaseI、RNase T1)后的RNA,进行cDNA文库构建与测序分析。
产品优势:
1.伯信独立研发。
2.紫外照射有效促进细胞内RNA与相应的RNA结合蛋白交联,增强RNA与蛋白的结合能力。
3.可检测多种RNA,如LncRNA、mRNA、microRNA。
4.CLIP-qPCR可精确定位RNA与蛋白的结合位点。
技术流程:
结果实例:
文章案例
Periodicals:Cell Biology and Toxicology
IF:5.300
Article: Linc00673-V3 positively regulates autophagy by promoting Smad3-mediated LC3B transcription in NSCLC.
Periodicals:Life science alliance
IF:3.300
Periodicals:Cell death discovery
IF:6.100
Article:YBX1 promotes type H vessel-dependent bone formation in an m5C-dependent manner
Periodicals:JCI insight
IF:6.300
Article:The CTBP2-PCIF1 complex regulates m6Am modification of mRNA in head and neck squamous cell carcinoma
Periodicals:The Journal of Clinical Investigation
IF:15.900
Periodicals:Translational Research
IF:10.171