染色体构象捕获技术（chromosome conformation capture，3C），是革新性的绘制染色质相互作用的工具，应用于酵母中研究基因表达时，染色质的空间构象分析，继而发展为在后生动物中研究细胞内染色质间的相互作用；3C 技术，能从全基因组的角度诠释了蛋白质因子与染色质相互作用的关系，以及细胞核内互作染色质的空间构象。

根据提供的基因序列，采用寡核苷酸设计软件，设计出候补探针序列，经数据库比对后，判断特异性合格后，按序列合成出对应的核酸序列并标记特定的标记物。

​根据提供的基因序列，采用寡核苷酸设计软件，设计出候补探针序列，经数据库比对后，判断特异性合格后，按序列合成出对应的核酸序列并标记特定的标记物。

DNA pull-down探针使用的是PCR法使基因启动子区域的DNA片段末端标记上生物素。

凝胶迁移或电泳迁移率检测(Electrophoretic mobility shift assay，EMSA)是研究启动子结合蛋白的经典方法，主要应用于定性和定量分析核酸蛋白相互作用。

RNA印迹杂交（Northern blot）是一种将RNA从凝胶中转移至尼龙膜上，通过检测RNA表达水平来检测基因表达的方法。