RNA印迹杂交（Northern blot）是一种将RNA从凝胶中转移至尼龙膜上，通过检测RNA表达水平来检测基因表达的方法。

RNA提取（磁珠法）是基于提取过程中待测样本裂解释放出的RNA在特定溶液中与磁珠特异性结合及洗脱释放，从而获得纯净的靶标RNA。

TRAP( tagged RNA affinity purification)是一种通过设计ncRNA-MS2载体与GST-MS2融合表达载体并共转细胞，以检测与ncRNA结合的蛋白质（RBPs）或RNA的研究方法。根据研究对象的不同，TRAP可与高通量测序、qPCR联用，鉴定与ncRNA结合的RNA种类与相互作用水平；或是与MS、Western blot联用，鉴定与ncRNA结合的蛋白质种类与结合强度。