RNA杂交系统
发布时间 :2016-10-25
RNA互作鉴定;分析RNA互作结构域
酵母四杂交系统的原理是在酵母双杂交系统的基础上改进的,用来验证RNA与RNA互作分析;从本质上来说,在质粒构建过程中就是比酵母双杂交系统多了一个基因表达框。
从原理和技术路线上是将两个已知的RNA结合蛋白分别与转录因子的DNA结合domain(如LexA)和激活结构域(activation domain)分别构建融合蛋白。此外构建两个杂合RNA,各自含有二个不同的结合位点,其中一个结合位点是与已知的RNA结合蛋白结合的颈环序列。当RNA与RNA相互作用时可激活报道基因的转录和表达。
1、RNA结合蛋白选用噬菌体MS2被壳蛋白(MS2 coat protein),MS2 coat protein可识别RNA中的21nt的茎环序列,并与之有较高的亲和力。
2、实验中需要用2个质粒表达杂合RNA,一个含有MS2 coat protein结合位点、另一个含有RNA类型的转录激活标签m26。
客户提供
① 互作RNA物种、名称、序列、基因ID;
② 突变位点序列信息;
伯信提供
① 载体构建过程图,测序结果;
② 实验报告(实验仪器、试剂、方法、结果、结论)。