分子探针与表观遗传学研究好文分享:alkbh5介导的m6A对circCCDC134修饰通过增强HIF1A转录促进宫颈癌转移(IF=12.658)
发布时间 :2022-08-31| BY :伯信官网
刊登于《Journal of Experimental & Clinical Cancer Research》(IF=12.658)

ALKBH5-mediated m6A modifcation of circCCDC134 facilitates cervical cancer metastasis by enhancing HIF1A transcriptionJournal of Experimental & Clinical Cancer Research(IF=12.658)




背景:


转移是子宫颈癌(CC)死亡的主要原因。环状rna已被证明在癌中的生物学中起着至关重要的作用。然而,环状rna在宫颈癌转移中的表达和功能尚不清楚。



方法:


在本研究中,我们鉴定了一种具有n6-甲基腺苷(m6A)修饰的circccdc134,通过circRNA-Seq和qPCR,其在CC组织中的表达增加。


CircCCDC134在CC中的上调是通过alkbh5介导的m6A修饰来调节的,这以ythdf2依赖的方式增强了其稳定性。


功能实验表明,circCCDC134在体内外均能增强肿瘤的增殖和转移。


为了全面鉴定RNA结合蛋白,我们使用circRNA下拉和质谱(ChIRP-MS)、染色质免疫沉淀-seq(ChIp-seq)、RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP)和荧光素酶报告分析来进行机制研究。



结果:


结果显示,circCCDC134在细胞核中招募p65,并作为miR-503-5p海绵调节细胞质中MYB的表达,最终刺激HIF1A转录,促进CC的生长和转移。



结论:


提示circCCDC134是一个重要的治疗靶点,为探索circcCCDC134在CC中的致癌机制提供了新的调控模型。








m6A修饰在环状rna的转录后调控和生物发生中起着关键作用,分析发现circCCDC134有许多m6A修饰位点。


为了进一步探索这一点,研究团队用TRAP、RIP、meRIP等技术进行分子调控机制研究。






TRAP分析和质谱分析来筛选circccdc134相互作用的蛋白和全面识别RNA结合蛋白;circCCDC134与多种蛋白合作,包括ALKBH5和YTHDF2;ALKBH5蛋白和YTHDF2蛋白可以与circCCDC134-MS2结合;circRNA下拉分析结果显示,miR-503-5p可以特异性地结合circCCDC134。





RIP检测结果表明,ALKBH5和YTHDF2都能与circCCDC134相互作用;运用m6A RNA免疫沉淀(MeRIP)定量circCCDC134的m6A水平,m6A qPCR检测circCCDC134的m6A甲基化状态;同时RIP检测也表明,与IgG组相比,Ago2组中circCCDC134和miR-503-5p的富集增加。


研究团队证明了circCCDC134不仅通过ceRNA机制发挥功能,而且通过招募p65发挥作用,ircCCDC134将p65招募到细胞核,并作为miR-503-5p海绵调节细胞质中MYB的表达,最终刺激HIF1A转录,促进CC的生长和转移。


强调了m6A去甲基化酶在circCCDC134表达中的吸引力价值,以及circCCDC134在增强细胞质和细胞核中HIF1A转录中的关键作用。



作者使用伯信生物明星产品TRAPRIP以及MeRIP三款试剂盒进行了上述分子互作调控机制的研究。





原文链接:https://jeccr.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13046-022-02462-7